Terminal Giwangan → Ringroad Selatan → S4. Dongkelan → Jln. Bantul → Jln. KH Wahid Hasyim → Terminal Ngabean → Jln. Letjen Suprapto → Bundaran Samsat → Jln. Tentara Pelajar → S4. Pingit → Jl Magelang → S4. Jombor → Terminal Jombor → S4. Jombor → Jalan Magelang → S4. Pingit → Jln. Tentara Pelajar → Bundaran Samsat → Jln. Letjen Suprapto → S4. Ngabean → Terminal Ngabean → Jln. KH Wahid Hasyim → S4. Jokteng Wetan → Jln. MT Haryono → Jln. Mayjen Sutoyo → S4. Jokteng Wetan → Jln. Parangtritis → S4. Druwo → Ringroad Selatan → Terminal Giwangan
Selain rute lengkap Trans Jogja Koridor 9 di atas, masih ada rute yang biasanya ada di Running Text bus atau tempelan kertas di belakang bus, diantaranya
9: Terminal Giwangan – Dongkelan – Ngabean – Samsat – Pingit – Terminal Jombor – Terminal Giwangan
